目前，拉美经济学科已经形成独具特色的理论研究和应用研究、区域研究和国别研究相结合的学科特点，在国内具有绝对的学术优势，在国外同学科研究中也具有一定的影响。在学术研究方面，拉美经济学科已经形成多层次开展学术研究的机制，在研究生教学方面，拉美经济学科已经形成独立培养经济学硕士和博士研究生的教学体制。其学术优势主要表现在以下几方面：

第一，作为我国唯一专门研究拉美经济的学科，其研究队伍的优势非常明显，成为国内拉美经济研究的学术基地。学科拥有一支既懂外语，又熟悉业务和研究对象，而且大多数都在研究对象国经过长期进修、考察的专业研究队伍。目前，拉美经济学科的7名40岁以下的科研人员都已经具有博士学位，或者正在攻读博士学位，他们全都参加了院重大课题的研究，其中3人还担任院、所重点课题的主持人。

第二，在加强理论研究的同时，拉美经济学科还注意应用研究，针对拉美经济和我国经济发展进程中的热点问题，将理论研究和应用研究相结合，因而受到国内政府部门和外国同行的重视。2006年，针对当前拉美同我国经贸关系迅速发展的特点，学科完成了专项课题《中拉贸易摩擦及我对策建议》，并依托该课题的研究成果，举办了专题学术研讨会进行成果推广。商务部和中国进出口银行的相关部门领导参会，并在会上作了主题演讲；新华社、《人民日报》等媒体记者也出席了会议。通过这种形式，科研人员和政府部门及企业人员对共同关注的热点问题和研究成果进行了深入的讨论和交流，最终不仅使外单位人员了解了我们的学术研究成果，同时课题组成员也了解了政府部门和企业关注的热点，为今后的深入研究奠定了基础。此外，结合党中央提出的建设和谐社会的战略目标，拉美经济学科全面启动了院重大课题《构建和谐社会面临的挑战——拉美人均GDP1000-3000美元阶段的经验教训》；结合我国的国情，学科申报了院重点课题《拉美的“三农”问题研究》；以及涉及可持续发展的课题也纳入学科研究的范围，如《资源诅咒假说与拉美的资源出口型发展模式》。

第三，采取国内外相结合，进一步扩大学科多层面对外交流的渠道，搭建起国内外合作的平台。随着我国经济的迅速发展，我国同世界各国的经济联系日益密切，其中同拉美国家的经贸合作成为一个积极的亮点。中国关注拉美，需要借鉴拉美国家经济发展的经验教训，以为我所用；拉美同样关注中国，期望从中国的发展中得到有益的启示，也希望利用我国发展的机遇，扩大中拉合作的规模。这为拉美经济学科的发展提供了极好的机遇，也为我学科在国内外开展多层次的学术交流创造了极为有利的条件。2006年全年学科内共有9人次分别前往7个国家进行学术访问或讲学。尤其值得一提的是，这一年本学科共有5人次前往拉美国家，这在拉美经济学科对外学术交流的历史上是没有过的，而且涉及的拉美国家数量之多也是过去所没有的。同年，拉美所利用联合国拉美经委会执行秘书率团来华参加与发改委共同举办的中国与拉美经委会第二次对话的机会，邀请该团来所访问。拉美经济学科成员在所长郑秉文率领下，参与了与拉美经委会代表团的工作会谈，双方探讨了今后进行课题合作研究的可能性。除此之外，拉美经济学科还接待了或参与接待了英国、巴西、墨西哥、西班牙和委内瑞拉等国的学者、官员或学生到访，利用一切机会扩大了拉美经济学科的对外影响。